Ako už bolo spomenuté, Robben sa kvôli častým zraneniam vždy potreboval dostať naspäť do formy, no v Reale si už miesto nájsť nedokázal a tak po dvoch rokoch v La Lige prestúpil do Bayernu. Fanúšikovia nemeckého veľkoklubu však z tejto posily neboli spočiatku vôbec nadšení, keďže Bavori v lete 2009 na tú dobu investovali výrazných 24 miliónov eur. V Mníchove ale rýchlonohý ofenzívny zabijak reštartoval svoje zašlé roky slávy.

V jeho prvej sezóne dal 23 gólov a s Bayernom vyhral Bundesligu a DFB-Pokal. Jeho znovuzrodeniu výrazne pomohol aj krajan na lavičke, Louis Van Gaal, ktorý sa ho snažil už druhý krát zlákať do Manchestru United po vydarených MS 2014, no Robben ostal verný Mníchovu. V Nemecku sa Robben dokonca stal v roku 2010 najlepším hráčom roka. Od svojho príchodu získal s Bayernom už mnoho veľkých trofejí vrátane šiestich domácich titulov, štyroch ligových pohárov a samozrejme triumfoval aj v Lige majstrov.