Futbalové kroky zaviali Javího Garcíu až do ďalekého Ruska, no málokto si pamätá na to, že 28-ročný defenzívny stredopoliar začínal s futbalom v Reale Madrid. Do jeho štruktúr vstúpil už ako deväťročný. V sedemnástich už hral za prvý tím Realu, hoci neskôr prišiel prestup do Osasuny, Madrid si Javiho stiahol pred sezónou 2008-2009. V nej odohral vysoký záložník 15 ligových zápasov, po ktorých prišiel prestup do Benfiky Lisabon. Po linke Lisabon – Manchester City – Petrohrad zamieril do miestneho Zenitu, s ktorým sa momentálne snaží uspieť v Európskej lige i ruskej súťaži.